Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp1b4Q99ME6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1b4Q99ME6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1b4Q99ME6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms