Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms