Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cstf3Q99LI7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.7 ms