Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5lQ99LH9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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