Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc5Q99LG4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc5Q99LG4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms