Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcf2Q99LE6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcf2Q99LE6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms