Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clint1Q99KN9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clint1Q99KN9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms