Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp11Q99K46 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp11Q99K46 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp11Q99K46 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp11Q99K46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp11Q99K46 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp11Q99K46 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp11Q99K46 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp11Q99K46 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms