Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufsp2Q99K23 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp2Q99K23 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms