Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlgn1Q99K10 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms