Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims1Q99JW4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms