Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd1Q99J36 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms