Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sfxn4Q925N1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sfxn4Q925N1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfxn4Q925N1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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