Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prss28Q924N9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prss28Q924N9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms