Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim59Q922Y2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim59Q922Y2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms