Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp4Q921I6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp4Q921I6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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