Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Odf3Q920N1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Odf3Q920N1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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