Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx15Q91WE1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx15Q91WE1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms