Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubtd1Q91WB7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubtd1Q91WB7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms