Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp3Q91W36 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp3Q91W36 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms