Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps3Q91VB4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms