Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms