Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc71Q8VEG0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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