Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrkQ8VDU5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms