Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX6

Kptn, KICSTOR complex protein kaptin, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KptnQ8VCX6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KptnQ8VCX6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KptnQ8VCX6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms