Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc9a8Q8R4D1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc9a8Q8R4D1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms