Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf1Q8R3P9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf1Q8R3P9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms