Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3I3

Cog6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog6Q8R3I3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog6Q8R3I3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog6Q8R3I3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms