Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R2K8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R2K8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms