Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms