Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh9Q8K5C8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms