Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi3Q8K406 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi3Q8K406 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms