Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r72Q8K3N7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms