Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk5rap2Q8K389 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap2Q8K389 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms