Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ncapd2Q8K2Z4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms