Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms