Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcf3Q8K268 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms