Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1eQ8K202 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms