Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek9Q8K1R7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek9Q8K1R7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms