Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FgbQ8K0E8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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FgbQ8K0E8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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FgbQ8K0E8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FgbQ8K0E8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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