Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbrd1Q8K0B2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbrd1Q8K0B2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms