Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pkn3Q8K045 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn3Q8K045 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms