Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d5Q8JZW5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d5Q8JZW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms