Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TwnkQ8CIW5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TwnkQ8CIW5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms