Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsnQ8CIT9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsnQ8CIT9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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