Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ep400Q8CHI8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ep400Q8CHI8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ep400Q8CHI8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ep400Q8CHI8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ep400Q8CHI8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ep400Q8CHI8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ep400Q8CHI8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ep400Q8CHI8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ep400Q8CHI8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms