Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc43a2Q8CGA3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc43a2Q8CGA3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms