Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc17Q8CE13 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc17Q8CE13 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms