Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc178Q8CDV0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc178Q8CDV0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc178Q8CDV0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms