Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8CDS7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8CDS7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CDS7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CDS7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms